Новости

Google DeepMind представила AlphaGenome — ИИ, анализирующий «тёмную» часть ДНК

Google DeepMind разработала систему искусственного интеллекта под названием AlphaGenome, способную моделировать влияние мельчайших изменений в некодирующих участках человеческой ДНК — тех, что долгое время считались незначимыми. Эти регионы составляют около 98% генома, и только недавно стало ясно, что именно они управляют включением и подавлением активности генов, играя решающую роль в развитии организма и возникновении заболеваний.

Даже при отсутствии мутаций в кодирующих участках, сбои в регуляторных зонах могут приводить к тяжёлым наследственным и онкологическим патологиям. AlphaGenome позволяет анализировать такие участки, обрабатывая ДНК-фрагменты длиной до миллиона нуклеотидов и прогнозируя тысячи молекулярных характеристик, связанных с их активностью.

Для понимания значимости этой технологии важно учитывать, как изменилась сама трактовка понятия «ген». В прошлом его связывали только с кодированием белков, но сегодня термин охватывает любые участки ДНК, чьи продукты (белки или РНК) задействованы в биологических процессах. При этом примерно 40% генома считаются активными, а назначение более миллиарда нуклеотидов всё ещё остаётся неизвестным.

Именно для изучения таких «неизученных» зон и была создана AlphaGenome. Система способна восстанавливать регуляторную логику работы генов и предсказывать, как даже одиночные мутации могут менять биохимические процессы. Один из примеров — мутация, приводящая к избыточной активности гена, связанного с лейкемией. ИИ смоделировал этот эффект с высокой точностью, совпав с данными лабораторных испытаний.

На данный момент доступ к AlphaGenome ограничен — система предоставляется только некоммерческим исследовательским группам. Однако уже сейчас к ней проявляют интерес как учёные, так и биотехнологические компании, рассчитывая с её помощью ускорить разработку методов лечения заболеваний, вызванных нарушениями в регуляции генов.

Вместе с тем, у технологии есть свои ограничения. Модель с трудом анализирует взаимодействие между отдалёнными фрагментами ДНК (на расстоянии более 100 тысяч оснований), не всегда корректно различает типы тканей, а также пока не адаптирована для анализа полного индивидуального генома. К тому же она не охватывает сложные заболевания, вызванные влиянием внешней среды или особенностями развития организма.

Несмотря на это, потенциал AlphaGenome огромен. Система отслеживает, как точечные мутации могут запускать цепочки молекулярных реакций, и помогает выстраивать карту генетических регуляторных связей, которые раньше были малоизучены.

Разработчики считают, что дальнейшее развитие AlphaGenome откроет путь к точечной терапии, направленной не на подавление симптомов, а на устранение самих причин генетических нарушений.